Stichting De Nationale DenkTank stelt ieder jaar een Nationale DenkTank samen. Dit is een multidisciplinair team van ongeveer twintig veelbelovende masterstudenten, pas afgestudeerden en promovendi. Deze DenkTank werkt gedurende drie maanden aan creatieve en innovatieve oplossingen voor een maatschappelijk probleem. Het team kan daarbij rekenen op de input van vele experts uit de wetenschap, het bedrijfsleven en uit overheidskringen. Daarnaast is er fulltime ondersteuning door een gerenommeerd adviesbureau. De DenkTank ontwikkelt concrete, innovatieve voorstellen die daadwerkelijk kunnen worden ingevoerd; deze worden gepresenteerd in een rapport dat voor iedereen beschikbaar is.

Innovatie vereist niet alleen kennis, maar vooral ook ondernemende en creatieve mensen die samen ideeën kunnen verwezenlijken. Met die visie werd Stichting De Nationale DenkTank in 2005 opgericht door een aantal jonge wetenschappers, ondersteund door de Universiteit van Amsterdam, Mckinsey & Company en het innovatieplatform. Het doel van de stichting is het opbouwen, onderhouden en faciliteren van een multidisciplinair netwerk van mensen met een brede blik en maatschappelijke interesse. Dit netwerk moet een brug vormen tussen overheid, wetenschap en bedrijfsleven, en kruisbestuiving tussen verschillende disciplines bevorderen. Het fungeert als broedplaats en broeinest voor vernieuwende ideeën, maatschappelijke initiatieven en ondernemingen.

De jaarlijkse DenkTank-projecten staan aan de basis van het netwerk. Na afsluiting van ieder project blijven de deelnemers als alumni betrokken bij de Stichting. Daarnaast verkrijgen zij het lidmaatschap van de "Jonge Maatschappij", een orgaan dat is opgericht in samenwerking met de Koninklijke Hollandsche Maatschappij der Wetenschappen. Deze instroom resulteert in het beoogde groeiende netwerk.