De Raad van Advies is al sinds de oprichting van de stichting in 2005 een belangrijke gesprekspartner van het bestuur. De raad denkt mee over het jaarlijkse thema van de DenkTank en adviseert de stichting bij strategische keuzes.
De Raad van Advies is ook het bestuur van de Stichting Avond van de Wetenschap en Maatschappij. Net als de Nationale DenkTank heeft deze stichting een maatschappelijke missie: zij wil meer aandacht voor de wetenschappelijke mening in het maatschappelijk debat en organiseert daartoe een jaarlijkse discussieavond.
